DrLLPS：真核生物液-液相分离的数据库

在真核生物中，细胞区室化是通过形成膜结合区室或无膜细胞器 (MLO)在不同化学环境中动态和瞬时组织复杂生化反应的基本原理。尽管前者已被很好地记录在案，但在蛋白质相分离或液-液相分离 (LLPS) 的机械分析最近取得进展之前，人们对后者知之甚少。LLPS 提供了一种简单但关键的机制来解释细胞如何在时空上产生 MLO，通过将蛋白质或核酸等生物分子的溶液浓缩成与稀相细胞质共存的密相液滴。化学势驱动 LLPS，后者反过来形成 MLO。迄今为止，大量的MLOs已经发现，包括但不限于应力颗粒，加工体（P-体），P颗粒，中心体，主轴装置和核仁。除了 MLOs，LLPS 还有助于其他亚细胞结构的形成，如异染色质、核孔复合物和受体簇，尽管常规的大分子组装机制对于核孔的形成也很重要。总的来说，MLOs组装经由LLPS用一个唯一的名称被称为，生物分子的缩合物，从而起到在调节多种生物过程，如应激反应，RNA新陈代谢，DNA损伤响应和信号转导的关键作用。在活细胞中，生物分子凝聚物的成核、形成和生物学特性受到精确调节，而 LLPS 相关蛋白的失调或突变与神经变性和癌症等人类疾病有关。

华中科技大学团队建立了一个真核生物液-液相分离的数据库——DrLLPS（http://llps.biocuckoo.cn/），该文章刊登在Nucleic Acids Research期刊（IF=16.971），题名为：DrLLPS: a data resource of liquid-liquid phase separation in eukaryotes。该数据库收集了9285 个实验鉴定的 LLPS 相关蛋白， 包括150 个作为 LLPS 驱动因素的支架蛋白、987 种有助于调节 LLPS 的调节剂，以及 8148 种可能对 MLO 形成可有可无的潜在目标蛋白，然后将其分类为 40 种生物分子缩合物。LLPS 的数据资源（DrLLPS）总共包含 437 887 个已知和潜在的 LLPS 相关蛋白，包括 164 个真核物种中的 7993 个支架、72 300 个调节剂和 357 594 个客户端。